Je travaille sur un projet de recherche concernant les écosystèmes côtiers et j aimerais savoir quel est le taux de séquestration du carbone par les forêts de mangroves
Mangrove virome

Mangrove forests are one of the most carbon-rich biomes, accounting for 11% of the total input of terrestrial carbon into oceans. Viruses are thought to significantly influence local and global biogeochemical cycles, though as of 2019 little information was available about the community structure, genetic diversity and ecological roles of viruses in mangrove ecosystems.

Viruses are the most abundant biological entities on earth, present in virtually all ecosystems. By lysing their hosts, that is, by rupturing their cell membranes, viruses control host abundance and affect the structure of host communities. Viruses also influence their host diversity and evolution through horizontal gene transfer, selection for resistance and manipulation of bacterial metabolisms. Importantly, marine viruses affect local and global biogeochemical cycles through the release of substantial amounts of organic carbon and nutrients from hosts and assist microbes in driving biogeochemical cycles with auxiliary metabolic genes (AMGs).

It is presumed AMGs augment viral-infected host metabolism and facilitate the production of new viruses. AMGs have been extensively explored in marine cyanophages and include genes involved in photosynthesis, carbon turnover, phosphate uptake and stress response. Cultivation-independent metagenomic analysis of viral communities has identified additional AMGs that are involved in motility, central carbon metabolism, photosystem I, energy metabolism, iron–sulphur clusters, anti-oxidation and sulphur and nitrogen cycling. Interestingly, a recent analysis of Pacific Ocean Virome data identified niche-specialised AMGs that contribute to depth-stratified host adaptations. Given that microbes drive global biogeochemical cycles, and a large fraction of microbes is infected by viruses at any given time, viral-encoded AMGs must play important roles in global biogeochemistry and microbial metabolic evolution.

Mangrove forests are the only woody halophytes that live in salt water along the world's subtropical and tropical coastlines. Mangroves are one of the most productive and ecologically important ecosystems on earth. The rates of primary production of mangroves equal those of tropical humid evergreen forests and coral reefs. As a globally relevant component of the carbon cycle, mangroves sequester approximately 24 million metric tons of carbon each year. Most mangrove carbon is stored in soil and sizable belowground pools of dead roots, aiding in the conservation and recycling of nutrients beneath forests. Although mangroves cover only 0.5% of the earth's coastal area, they account for 10–15% of the coastal sediment carbon storage and 10–11% of the total input of terrestrial carbon into oceans. The disproportionate contribution of mangroves to carbon sequestration is now perceived as an important means to counterbalance greenhouse gas emissions.

Despite the ecological importance of mangrove ecosystem, knowledge on mangrove biodiversity is notably limited. Previous reports mainly investigated the biodiversity of mangrove fauna, flora and bacterial communities. Particularly, little information is available about viral communities and their roles in mangrove soil ecosystems. In view of the importance of viruses in structuring and regulating host communities and mediating element biogeochemical cycles, exploring viral communities in mangrove ecosystems is essential. Additionally, the intermittent flooding of sea water and resulting sharp transition of mangrove environments may result in substantially different genetic and functional diversity of bacterial and viral communities in mangrove soils compared with those of other systems.
Un mangrove est un arbuste ou un arbre qui pousse principalement dans des eaux côtières salines ou saumâtres. Les mangroves prospèrent dans un climat équatorial, généralement le long des côtes et des rivières marégantes. Elles possèdent des adaptations spéciales pour absorber l'oxygène supplémentaire et éliminer le sel, ce qui leur permet de tolérer des conditions qui tueraient la plupart des plantes. Le terme est également utilisé pour désigner la végétation côtière tropicale composée de telles espèces. Les mangroves sont taxonomiquement diversifiées, résultat d'une évolution convergente au sein de plusieurs familles de plantes. On les trouve dans le monde entier dans les régions tropicales et subtropicales, et même dans certaines zones côtières tempérées, principalement entre les latitudes 30° N et 30° S, avec la plus grande superficie de mangroves à moins de 5° de l'équateur. Les familles de plantes des mangroves sont apparues pour la première fois pendant les époques du Crétacé supérieur au Paléocène, et se sont largement répandues en partie à cause du mouvement des plaques tectoniques. Les plus anciens fossiles connus de palmiers des mangroves datent de 75 millions d'années.

Les mangroves sont des arbres, des arbustes et des fougères tolérants au sel, également appelés halophytes, et sont adaptés pour vivre dans des conditions côtières difficiles. Elles possèdent un système complexe de filtration du sel et un système racinaire complexe pour faire face à l'immersion dans l'eau salée et à l'action des vagues. Elles sont adaptées aux conditions de faible oxygénation des sols gorgés d'eau, mais sont le plus susceptible de prospérer dans la moitié supérieure de la zone intertidale.

Le biome des mangroves, souvent appelé forêt de mangroves ou mangal, est un habitat forestier ou arbustif salin distinct, caractérisé par des environnements côtiers sédimentaires, où les sédiments fins (souvent riches en matière organique) s'accumulent dans des zones protégées de l'action des vagues à haute énergie. Les forêts de mangroves servent d'habitats vitaux pour une grande variété d'espèces aquatiques, offrant un écosystème unique qui soutient l'interaction complexe de la vie marine et de la végétation terrestre. Les conditions salines tolérées par les différentes espèces de mangroves varient de l'eau saumâtre à l'eau de mer pure (3 à 4 % de salinité), jusqu'à l'eau concentrée par évaporation à plus du double de la salinité de l'eau de mer océanique (jusqu'à 9 % de salinité).

À partir de 2010, les technologies de télédétection et les données mondiales ont été utilisées pour évaluer les superficies, les conditions et les taux de déforestation des mangroves dans le monde entier. En 2018, l'initiative Global Mangrove Watch a publié une nouvelle base de référence mondiale estimant la superficie totale des forêts de mangroves dans le monde en 2010 à 137 600 km² (53 100 miles carrés), couvrant 118 pays et territoires. Une étude de 2022 sur les pertes et les gains des zones humides intertidales estime une diminution nette de 3 700 km² (1 400 miles carrés) de l'étendue mondiale des mangroves entre 1999 et 2019. La perte de mangroves se poursuit en raison de l'activité humaine, avec un taux de déforestation annuel mondial estimé à 0,16 %, et des taux par pays pouvant atteindre 0,70 %. La dégradation de la qualité des mangroves restantes est également une préoccupation importante.

Il existe un intérêt pour la restauration des mangroves pour plusieurs raisons. Les mangroves soutiennent des écosystèmes côtiers et marins durables. Elles protègent les zones voisines des tsunamis et des événements météorologiques extrêmes. Les forêts de mangroves sont également efficaces pour la séquestration et le stockage du carbone. Le succès de la restauration des mangroves peut dépendre fortement de l'implication des acteurs locaux et d'une évaluation minutieuse pour s'assurer que les conditions de croissance seront appropriées pour les espèces choisies.

La Journée internationale de la conservation de l'écosystème des mangroves est célébrée chaque année le 26 juillet.
### Query ###
Je travaille sur un projet de recherche concernant les écosystèmes côtiers et j aimerais savoir quel est le taux de séquestration du carbone par les forêts de mangroves

### Main Text ###
Mangrove virome

Mangrove forests are one of the most carbon-rich biomes, accounting for 11% of the total input of terrestrial carbon into oceans. Viruses are thought to significantly influence local and global biogeochemical cycles, though as of 2019 little information was available about the community structure, genetic diversity and ecological roles of viruses in mangrove ecosystems.

Viruses are the most abundant biological entities on earth, present in virtually all ecosystems. By lysing their hosts, that is, by rupturing their cell membranes, viruses control host abundance and affect the structure of host communities. Viruses also influence their host diversity and evolution through horizontal gene transfer, selection for resistance and manipulation of bacterial metabolisms. Importantly, marine viruses affect local and global biogeochemical cycles through the release of substantial amounts of organic carbon and nutrients from hosts and assist microbes in driving biogeochemical cycles with auxiliary metabolic genes (AMGs).

It is presumed AMGs augment viral-infected host metabolism and facilitate the production of new viruses. AMGs have been extensively explored in marine cyanophages and include genes involved in photosynthesis, carbon turnover, phosphate uptake and stress response. Cultivation-independent metagenomic analysis of viral communities has identified additional AMGs that are involved in motility, central carbon metabolism, photosystem I, energy metabolism, iron–sulphur clusters, anti-oxidation and sulphur and nitrogen cycling. Interestingly, a recent analysis of Pacific Ocean Virome data identified niche-specialised AMGs that contribute to depth-stratified host adaptations. Given that microbes drive global biogeochemical cycles, and a large fraction of microbes is infected by viruses at any given time, viral-encoded AMGs must play important roles in global biogeochemistry and microbial metabolic evolution.

Mangrove forests are the only woody halophytes that live in salt water along the world's subtropical and tropical coastlines. Mangroves are one of the most productive and ecologically important ecosystems on earth. The rates of primary production of mangroves equal those of tropical humid evergreen forests and coral reefs. As a globally relevant component of the carbon cycle, mangroves sequester approximately 24 million metric tons of carbon each year. Most mangrove carbon is stored in soil and sizable belowground pools of dead roots, aiding in the conservation and recycling of nutrients beneath forests. Although mangroves cover only 0.5% of the earth's coastal area, they account for 10–15% of the coastal sediment carbon storage and 10–11% of the total input of terrestrial carbon into oceans. The disproportionate contribution of mangroves to carbon sequestration is now perceived as an important means to counterbalance greenhouse gas emissions.

Despite the ecological importance of mangrove ecosystem, knowledge on mangrove biodiversity is notably limited. Previous reports mainly investigated the biodiversity of mangrove fauna, flora and bacterial communities. Particularly, little information is available about viral communities and their roles in mangrove soil ecosystems. In view of the importance of viruses in structuring and regulating host communities and mediating element biogeochemical cycles, exploring viral communities in mangrove ecosystems is essential. Additionally, the intermittent flooding of sea water and resulting sharp transition of mangrove environments may result in substantially different genetic and functional diversity of bacterial and viral communities in mangrove soils compared with those of other systems.

### Supplementary Text ###
Un mangrove est un arbuste ou un arbre qui pousse principalement dans des eaux côtières salines ou saumâtres. Les mangroves prospèrent dans un climat équatorial, généralement le long des côtes et des rivières marégantes. Elles possèdent des adaptations spéciales pour absorber l'oxygène supplémentaire et éliminer le sel, ce qui leur permet de tolérer des conditions qui tueraient la plupart des plantes. Le terme est également utilisé pour désigner la végétation côtière tropicale composée de telles espèces. Les mangroves sont taxonomiquement diversifiées, résultat d'une évolution convergente au sein de plusieurs familles de plantes. On les trouve dans le monde entier dans les régions tropicales et subtropicales, et même dans certaines zones côtières tempérées, principalement entre les latitudes 30° N et 30° S, avec la plus grande superficie de mangroves à moins de 5° de l'équateur. Les familles de plantes des mangroves sont apparues pour la première fois pendant les époques du Crétacé supérieur au Paléocène, et se sont largement répandues en partie à cause du mouvement des plaques tectoniques. Les plus anciens fossiles connus de palmiers des mangroves datent de 75 millions d'années.

Les mangroves sont des arbres, des arbustes et des fougères tolérants au sel, également appelés halophytes, et sont adaptés pour vivre dans des conditions côtières difficiles. Elles possèdent un système complexe de filtration du sel et un système racinaire complexe pour faire face à l'immersion dans l'eau salée et à l'action des vagues. Elles sont adaptées aux conditions de faible oxygénation des sols gorgés d'eau, mais sont le plus susceptible de prospérer dans la moitié supérieure de la zone intertidale.

Le biome des mangroves, souvent appelé forêt de mangroves ou mangal, est un habitat forestier ou arbustif salin distinct, caractérisé par des environnements côtiers sédimentaires, où les sédiments fins (souvent riches en matière organique) s'accumulent dans des zones protégées de l'action des vagues à haute énergie. Les forêts de mangroves servent d'habitats vitaux pour une grande variété d'espèces aquatiques, offrant un écosystème unique qui soutient l'interaction complexe de la vie marine et de la végétation terrestre. Les conditions salines tolérées par les différentes espèces de mangroves varient de l'eau saumâtre à l'eau de mer pure (3 à 4 % de salinité), jusqu'à l'eau concentrée par évaporation à plus du double de la salinité de l'eau de mer océanique (jusqu'à 9 % de salinité).

À partir de 2010, les technologies de télédétection et les données mondiales ont été utilisées pour évaluer les superficies, les conditions et les taux de déforestation des mangroves dans le monde entier. En 2018, l'initiative Global Mangrove Watch a publié une nouvelle base de référence mondiale estimant la superficie totale des forêts de mangroves dans le monde en 2010 à 137 600 km² (53 100 miles carrés), couvrant 118 pays et territoires. Une étude de 2022 sur les pertes et les gains des zones humides intertidales estime une diminution nette de 3 700 km² (1 400 miles carrés) de l'étendue mondiale des mangroves entre 1999 et 2019. La perte de mangroves se poursuit en raison de l'activité humaine, avec un taux de déforestation annuel mondial estimé à 0,16 %, et des taux par pays pouvant atteindre 0,70 %. La dégradation de la qualité des mangroves restantes est également une préoccupation importante.

Il existe un intérêt pour la restauration des mangroves pour plusieurs raisons. Les mangroves soutiennent des écosystèmes côtiers et marins durables. Elles protègent les zones voisines des tsunamis et des événements météorologiques extrêmes. Les forêts de mangroves sont également efficaces pour la séquestration et le stockage du carbone. Le succès de la restauration des mangroves peut dépendre fortement de l'implication des acteurs locaux et d'une évaluation minutieuse pour s'assurer que les conditions de croissance seront appropriées pour les espèces choisies.

La Journée internationale de la conservation de l'écosystème des mangroves est célébrée chaque année le 26 juillet.

### Draft ###

### 1. Query Parsing

"quel est le taux de séquestration du carbone par les forêts de mangroves"

→ Carbon sequestration rates for mangrove forests
→ Research project context suggests need for quantitative data
→ French technical terminology, specialized ecological domain

### 2. Information Retrieval Assessment

● High confidence: Mangroves sequester significant carbon
◐ Partial: Exact global rates vary by study
○ Low confidence: Regional variations substantial
⚠ Potential bias: Most data from Southeast Asia/Pacific

### 3. Quantitative Analysis

Global sequestration estimates:
- ~24 million metric tons CO₂ annually ●
- 10-11% of terrestrial carbon input to oceans ●  
- Carbon storage: ~200-400 gC/m² per year ●
- Soil carbon density: 1000-2000 MgC/ha in some sites ◐

Key constraint: Most carbon stored in soils, not biomass
→ Belowground carbon pools critical

### 4. Ecological Context

Mangrove coverage: <0.5% global coastal area
Contribution to carbon storage: 10-15% coastal sediment carbon
→ Disproportionate impact relative to area

Productivity comparison: ≈ tropical rainforest levels
But different carbon cycling dynamics

### 5. Geographic/Temporal Considerations

High variability:
- Tropical regions (30°N to 30°S latitude)
- Tidal patterns influence sequestration
- Recent data suggests higher rates than previously estimated
- Climate change impacts on rates ⚠

### 6. Research Implications

For coastal ecosystem research projects:
- Rates support blue carbon initiatives
- Soil sampling critical for accurate measurement  
- Time since establishment affects sequestration
- Restoration potential significant

### 7. Synthesis

⟨H≈0.8⟩ Mangroves: coastal guardians of carbon, silent sentinels where saltwater meets sky, their roots breathing in atmospheric CO₂ while their soils become tombs for millennia of stored carbon... The numbers tell part of the story - 24 million tons annually, 11% of oceanic carbon - but miss the deeper truth of these ecosystems as planetary carbon sinks unlike any other...

∴ Global average: ~24 million metric tons CO₂/year sequestration
∴ Soil carbon storage dominates aboveground biomass
∴ Regional variability high (10-15% coastal carbon storage)
∴ Research focus should emphasize soil sampling methodology

### Answer###
Les forêts de mangroves séquestrent approximativement 24 millions de tonnes métriques de carbone chaque année. Ces écosystèmes sont parmi les plus riches en carbone sur la planète et contribuent à 10-11% des apports terrestres de carbone dans les océans, malgré le fait qu'ils ne couvrent que 0,5% de la superficie côtière mondiale.

La plupart du carbone des mangroves est stocké dans les sols et dans des réservoirs considérables de racines mortes souterraines. Ces forêts ont des taux de production primaire équivalents à ceux des forêts humides tropicales sempervirentes, et leur contribution disproportionnée à la séquestration du carbone est désormais reconnue comme un moyen important pour contrebalancer les émissions de gaz à effet de serre.

Il est important de noter que les mangroves stockent 10-15% du carbone des sédiments côtiers et que la moitié du carbone séquestré se trouve généralement dans les 20 premiers centimètres du sol. Cette caractéristique les rend particulièrement efficaces pour le stockage à long terme du carbone dans les écosystèmes côtiers.