Je comprends pas pourquoi certains acides aminés sont essentiels et d'autres pas pour l'homme. Est-ce que quelqu'un peut m'expliquer simplement pourquoi on en fabrique certains et pas d'autres ?
Proteins

Organisms vary in their ability to synthesize the 20 common amino acids. Most bacteria and plants can synthesize all twenty, but mammals can only synthesize eleven nonessential amino acids, so nine essential amino acids must be obtained from food. Some simple parasites, such as the bacteria Mycoplasma pneumoniae, lack all amino acid synthesis and take their amino acids directly from their hosts. All amino acids are synthesized from intermediates in glycolysis, the citric acid cycle, or the pentose phosphate pathway. Nitrogen is provided by glutamate and glutamine. Nonessensial amino acid synthesis depends on the formation of the appropriate alpha-keto acid, which is then transaminated to form an amino acid.

Amino acids are made into proteins by being joined in a chain of peptide bonds. Each different protein has a unique sequence of amino acid residues: this is its primary structure. Just as the letters of the alphabet can be combined to form an almost endless variety of words, amino acids can be linked in varying sequences to form a huge variety of proteins. Proteins are made from amino acids that have been activated by attachment to a transfer RNA molecule through an ester bond. This aminoacyl-tRNA precursor is produced in an ATP -dependent reaction carried out by an aminoacyl tRNA synthetase. This aminoacyl-tRNA is then a substrate for the ribosome, which joins the amino acid onto the elongating protein chain, using the sequence information in a messenger RNA.
Un acide aminé essentiel, ou indispensable, est un acide aminé que l'organisme ne peut pas synthétiser à partir de zéro assez rapidement pour répondre à ses besoins, et doit donc provenir de l'alimentation. Sur les 21 acides aminés communs à toutes les formes de vie, les neuf acides aminés que les humains ne peuvent pas synthétiser sont la valine, l'isoleucine, la leucine, la méthionine, la phénylalanine, le tryptophane, la thréonine, l'histidine et la lysine. Six autres acides aminés sont considérés comme conditionnellement essentiels dans l'alimentation humaine, ce qui signifie que leur synthèse peut être limitée dans des conditions pathophysiologiques particulières, telles que la prématurité chez le nourrisson ou chez les individus en état de détresse catabolique sévère. Ces six sont l'arginine, la cystéine, la glycine, la glutamine, la proline et la tyrosine. Six acides aminés sont non essentiels (dispensables) chez l'homme, ce qui signifie qu'ils peuvent être synthétisés en quantités suffisantes dans le corps. Ces six sont l'alanine, l'acide aspartique, l'asparagine, l'acide glutamique, la sérine et la sélénocystéine. La pyrrolysine, qui n'est protéinogène que chez certains microorganismes, n'est pas utilisée et est donc non essentielle pour la plupart des organismes, y compris les humains. L'acide aminé limitant est l'acide aminé essentiel le plus éloigné de la satisfaction des besoins nutritionnels. Ce concept est important lors de la détermination de la sélection, du nombre et de la quantité d'aliments à consommer, car même lorsque les protéines totales et tous les autres acides aminés essentiels sont satisfaits, si l'acide aminé limitant ne l'est pas, le repas est considéré comme étant nutritionnellement limité par cet acide aminé.
### Query ###
Je comprends pas pourquoi certains acides aminés sont essentiels et d'autres pas pour l'homme. Est-ce que quelqu'un peut m'expliquer simplement pourquoi on en fabrique certains et pas d'autres ?

### Main Text ###
Proteins

Organisms vary in their ability to synthesize the 20 common amino acids. Most bacteria and plants can synthesize all twenty, but mammals can only synthesize eleven nonessential amino acids, so nine essential amino acids must be obtained from food. Some simple parasites, such as the bacteria Mycoplasma pneumoniae, lack all amino acid synthesis and take their amino acids directly from their hosts. All amino acids are synthesized from intermediates in glycolysis, the citric acid cycle, or the pentose phosphate pathway. Nitrogen is provided by glutamate and glutamine. Nonessensial amino acid synthesis depends on the formation of the appropriate alpha-keto acid, which is then transaminated to form an amino acid.

Amino acids are made into proteins by being joined in a chain of peptide bonds. Each different protein has a unique sequence of amino acid residues: this is its primary structure. Just as the letters of the alphabet can be combined to form an almost endless variety of words, amino acids can be linked in varying sequences to form a huge variety of proteins. Proteins are made from amino acids that have been activated by attachment to a transfer RNA molecule through an ester bond. This aminoacyl-tRNA precursor is produced in an ATP -dependent reaction carried out by an aminoacyl tRNA synthetase. This aminoacyl-tRNA is then a substrate for the ribosome, which joins the amino acid onto the elongating protein chain, using the sequence information in a messenger RNA.

### Supplementary Text ###
Un acide aminé essentiel, ou indispensable, est un acide aminé que l'organisme ne peut pas synthétiser à partir de zéro assez rapidement pour répondre à ses besoins, et doit donc provenir de l'alimentation. Sur les 21 acides aminés communs à toutes les formes de vie, les neuf acides aminés que les humains ne peuvent pas synthétiser sont la valine, l'isoleucine, la leucine, la méthionine, la phénylalanine, le tryptophane, la thréonine, l'histidine et la lysine. Six autres acides aminés sont considérés comme conditionnellement essentiels dans l'alimentation humaine, ce qui signifie que leur synthèse peut être limitée dans des conditions pathophysiologiques particulières, telles que la prématurité chez le nourrisson ou chez les individus en état de détresse catabolique sévère. Ces six sont l'arginine, la cystéine, la glycine, la glutamine, la proline et la tyrosine. Six acides aminés sont non essentiels (dispensables) chez l'homme, ce qui signifie qu'ils peuvent être synthétisés en quantités suffisantes dans le corps. Ces six sont l'alanine, l'acide aspartique, l'asparagine, l'acide glutamique, la sérine et la sélénocystéine. La pyrrolysine, qui n'est protéinogène que chez certains microorganismes, n'est pas utilisée et est donc non essentielle pour la plupart des organismes, y compris les humains. L'acide aminé limitant est l'acide aminé essentiel le plus éloigné de la satisfaction des besoins nutritionnels. Ce concept est important lors de la détermination de la sélection, du nombre et de la quantité d'aliments à consommer, car même lorsque les protéines totales et tous les autres acides aminés essentiels sont satisfaits, si l'acide aminé limitant ne l'est pas, le repas est considéré comme étant nutritionnellement limité par cet acide aminé.

### Draft ###

### 1. Query Parsing

"Je comprends pas pourquoi certains acides aminés sont essentiels..." → Core confusion: why some amino acids essential, others not for humans.

"pourquoi on en fabrique certains et pas d'autres" → Translation issue? User likely means "why body can/cannot synthesize them." Not about industrial production.

Simple information retrieval + biological reasoning. Need biochemistry fundamentals.

### 2. Essential vs Non-Essential Framework

Human amino acid synthesis capacity:
- Essential: 9 amino acids (9/21 total)
- Non-essential: 11 amino acids (can synthesize)
- Conditional: 6 more under stress conditions

● High confidence on these numbers. Standard biological knowledge.

Essential 9: Valine, isoleucine, leucine, methionine, phenylalanine, tryptophan, threonine, histidine, lysine.

Why this distribution? → Evolutionary constraints + biochemical pathways.

### 3. Synthesis Pathways Analysis

Non-essential amino acids synthesized via:
- Metabolic intermediates from glycolysis/citric acid cycle/pentose phosphate pathway
- Nitrogen from glutamate/glutamine
- Specialized enzymatic conversions

Key insight: ! Body has complete enzymatic machinery for most common amino acids.

Missing enzymes → Essential status. For example:
- Phenylalanine → tyrosine (one enzyme missing in humans)
- But tyrosine → phenylalanine (enzyme present) → Why phenylalanine essential, tyrosine not

### 4. Evolutionary Perspective

⟨H≈0.8⟩ Ancient metabolic toolkit... what our primate ancestors retained vs lost. Maybe we sacrificed exotic pathway X for more efficient Y? Or environmental pressures changed which foods available, making certain syntheses unnecessary? Island populations evolving different essential profiles...

Back to concrete: ◐ Most mammals share this 11/9 distribution. Some exceptions exist (certain rodents can synthesize more).

### 5. Conditional Essentials

Stress/illness situations:
- Arginine, cysteine, glycine, glutamine, proline, tyrosine become limiting
- Premature infants, severe catabolic states
- ∴ Nutritional requirements vary by physiological context

### 6. Verification Check

Physical constraints support this:
- Carbon skeletons: all from basic metabolic pathways ✓
- Nitrogen sources: abundant in diet ✓  
- Enzyme deficiencies: specific, explainable ✓
- Evolutionary logic: consistent across mammals ✓

### 7. Practical Implications

Dietary planning requires knowing this:
- Essential amino acids → must be consumed
- Non-essential → adequate protein intake sufficient
- Conditional → extra attention during stress

※ User likely needs this practical angle for understanding.

### 8. Synthesis

Core answer: Human body optimized for 11/21 amino acid synthesis. Missing enzymatic steps create essential status for others. Evolutionary trade-offs. Stress conditions can make previously non-essential amino acids limiting.

Simple explanation: Think of amino acids as tools in a toolbox. Body built complete set for most common needs, but few specialized tools missing. Those missing ones must be borrowed from diet.

✓ Addresses user's confusion
✓ Explains biological logic  
✓ Connects to practical applications

### Answer###
La raison pour laquelle certains acides aminés sont essentiels et d'autres non chez l'homme s'explique par les capacités de synthèse de notre organisme. Sur les 21 acides aminés totaux, seulement 11 acides aminés non essentiels peuvent être fabriqués par le corps humain à partir d'intermédiaires du métabolisme, notamment les cycles de glycolyse, du cycle de Krebs ou du shunt des pentoses phosphates.

Ces 11 acides aminés non essentiels sont synthétisés grâce à la formation d'acides alpha-cétogènes appropriés, qui sont ensuite transaminés pour former l'acide aminé final. L'azote nécessaire provient généralement de glutamate et de glutamine.

En revanche, 9 acides aminés essentiels doivent impérativement être apportés par l'alimentation car l'organisme ne peut pas les produire en quantité suffisante : valine, isoleucine, leucine, méthionine, phénylalanine, tryptophane, thréonine, histidine et lysine. Six autres acides aminés sont considérés comme conditionnellement essentiels dans l'alimentation humaine, leur synthèse pouvant être limitée dans des conditions particulières comme la prématurité ou l'état de stress métabolique sévère.

Cette distribution reflète les contraintes évolutives et métaboliques qui ont façonné les capacités de synthèse des mammifères, même si les besoins nutritionnels peuvent varier selon l'âge, l'état de santé et les conditions particulières de chaque individu.